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养殖水体要求水质达到“肥、活、嫩、爽”。水体中要有丰富的营养，这其中的营养成分是有机和无机盐类组成，可以促进水体藻类和微生物的生长和繁殖。在养殖过程中，肥水的目的就是为了培养水中丰富的有益的藻类，这些藻类属于最早生产者，不仅给水体提供了溶氧，同时也可以给水生动物提供了食物。
而养殖的水生动物则属于消费者，在谋求自身的生长过程中就要消耗营养，就需要投喂的大量食物，而吃不完的残饵或粪便，在分解者有益菌的作用下最终矿化，最终又被藻类利用，这样就建立了完整的生态系统，而这个生态系统又非常脆弱，一旦平衡被打破，各种问题就会出现，轻则发生水变，重则导致养殖动物的死亡。
如果出现营养不均衡就会导致藻类培养失败，难以肥水，必要时要对水体进行检测，根据营养成分的多寡进行合理的补减；如果水体中营养源过多时，就容易导致藻类的大量生长和繁殖，水色过绿、过浓，在水中某种营养源过高时，就会出现某种藻类生长过快而出现“倒藻”或“水变”。
如果说藻类的生长和繁殖离不开矿化的营养物质，而有益菌的生长和繁殖则离不开水体中大量的有机物，而净化水质就是利用有益菌能够分解和利用有机质的作用。有益菌在分解有机氮（粪便、残饵，氨氮、亚盐等）的同时，需要大量的碳源作为支撑，有益菌在水体中正常分解有机氮的碳氮比为10-15:1）。
有机质含量过多而有益菌繁殖过少时，则在溶氧不足的情况下，就非常容易导致中间产物氨氮和亚盐。所以想要降解氨氮、亚盐，水中多余的有机质时就必须补充有益菌和碳源。这也是为什么在降解氨氮、亚盐或有机质时，需要用有益菌+红糖（有机碳源）。
所以在养殖过程中，有良好有序的水环境非常重要，向水体中补充有机碳、氮和无机氮、磷、钾或微量元素就是为了平衡菌相藻相的水环境，让养殖能够顺利进行。
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